El Consejo Superior de la Universidad Pedagógica y Tecnológica de Colombia, bajo la vigencia de la Ley 200 de 1995 (anterior Código Disciplinario Único) creó la Oficina de Control Interno Disciplinario mediante el Acuerdo No. 022 de 2001. Actualmente la Dirección de Control Interno Disciplinario, es una dependencia adscrita a la Rectoría y sus funciones vigentes se encuentran establecidas en el Acuerdo del Consejo Superior No. 01 de 2018.
La Dirección de Control Interno Disciplinario de la Universidad Pedagógica y Tecnológica de Colombia, tiene como función principal velar por el mantenimiento del orden y el respeto por los derechos de los miembros de la comunidad universitaria y la ética de lo público, la transparencia de la gestión pública a cargo de la Universidad, propender por la integridad de los intereses institucionales, la disciplina y la observancia de las normas externas y propias de ésta institución; pilares fundamentales para el correcto desempeño de las labores que comprenden la función y el servicio esencial que presta la Universidad Pedagógica y Tecnológica de Colombia; aplicando el Código Único Disciplinario, con el fin de lograr el cumplimiento de la función pública asignada a este ente educativo.